Kako odpreti, urediti in pretvoriti PDB datoteke
Datoteka s pripono PDB datoteke je najverjetneje datoteka, ki je bila ustvarjena v formatu Programske zbirke podatkov, ki se uporablja za shranjevanje informacij o programu ali modulu, kot je datoteka DLL ali EXE . Včasih se imenujejo simbolne datoteke.
Datoteke PDB mapirajo različne sestavne dele in izjave v izvorno kodo na svoj končni izdelek, ki ga razhroščevalnik lahko uporabi pri iskanju izvorne datoteke in lokacije v izvedljivi datoteki, na kateri naj ustavi proces odpravljanja napak.
Nekatere PDB datoteke se lahko namesto tega nahajajo v obliki zapisa datoteke podatkovnih baz Protein. Te datoteke PDB so datoteke z navadnim besedilom, ki shranjujejo koordinate v zvezi s strukturami proteinov.
Druge datoteke PDB so verjetno ustvarjene v obliki datoteke Palm Database ali PalmDOC in se uporabljajo v operacijskem sistemu PalmOS. Nekatere datoteke v tem formatu namesto tega uporabljajo razširitev datoteke .PRC.
Kako odpreti PDB datoteko
Različni programi uporabljajo svojo lastno PDB datoteko za shranjevanje podatkov v nekem strukturiranem formatu baze podatkov, tako da se vsaka aplikacija uporablja za odpiranje lastne vrste PDB datoteke. Geneous, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio in Pegasus sta le nekaj primerov programov, ki bi lahko kot datoteko zbirke podatkov uporabljali PDB datoteko. Radare in PDBparse bi lahko delovali tudi pri odpiranju datotek PDB.
Nekatere PDB datoteke so shranjene kot navaden tekst, kot so datoteke Geneous 'Debug Database Program in so povsem človeško berljive, če jih odprete v urejevalniku besedil. To vrsto PDB datoteke lahko odprete s katerim koli programom, ki lahko prebere besedilne dokumente, kot je vgrajen program Notepad v sistemu Windows. Nekateri drugi gledalci in uredniki PDB datotek vključujejo Notepad ++ in Brackets.
Druge datoteke PDB baze podatkov niso dokumenti z besedilom in so uporabne le, če jih odprete s programom, za katerega je namenjen. Na primer, če je vaša PDP datoteka nekako povezana s Quickenjem, poskusite uporabiti to programsko opremo za ogled ali urejanje datoteke PDB. Visual Studio pričakuje, da bo datoteka PDB v isti mapi kot datoteka DLL ali EXE.
Ogledate si lahko in urejate PDB datoteke, ki so datoteki Protein Data Bank, v operacijskih sistemih Windows, Linux in MacOS z Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB in USCF Chimera lahko odprejo tudi datoteko PDB. Ker so te datoteke povsem besedilo, lahko datoteko PDB odprete tudi v urejevalniku besedil.
Palm Desktop mora imeti možnost, da odpre datoteke PDB, ki so v obliki datoteke datoteke Palm Database, vendar ga boste morda morali najprej preimenovati, da bo razširitev datoteke .PRC za ta program prepoznala. Če želite odpreti PDD-datoteko PalmDOC, poskusite s pregledovalnikom STDU.
Kako pretvoriti PDB datoteko
Datoteke Programske zbirke podatkov najverjetneje ne bodo pretvorile v drugačno obliko datoteke, vsaj ne z običajnim orodjem za pretvorbo datotek . Namesto tega, če obstaja orodje, ki lahko pretvori tovrstno datoteko PDB, bi bil isti program, ki ga lahko odpre.
Na primer, če morate pretvoriti datoteko baze podatkov PDB iz Quicken, poskusite uporabiti ta program, da to storite. Vendar ta vrsta pretvorbe verjetno ni le malo uporabna, temveč tudi v teh aplikacijah zbirke podatkov ni podprta (tj. Verjetno vam ni treba pretvoriti te vrste PDB datoteke v katero koli drugo obliko).
Datoteke Podatkovnih zbirk Protein se lahko pretvorijo v druge oblike z MeshLab. Če želite to narediti, boste morda najprej pretvorili PDB datoteko v WRL z PyMOL iz menija File> Save Image As> VRML in nato uvozite datoteko WRL v MeshLab in uporabite meni File> Export Mesh As, da končno pretvorite PPP datoteko v STL ali drug format datoteke.
Če ne potrebujete barvnega modela, lahko datoteko PDB neposredno izvozite v STL z USCF Chimera (link za prenos je zgoraj). V nasprotnem primeru lahko uporabite isto metodo kot zgoraj (z MeshLab) za pretvorbo PDB v WRL s USCF Chimera in nato izvozite WRL datoteko v STL z MeshLab.
Če želite pretvoriti PDB v PDF ali EPUB , če imate datoteko PalmDOC, je mogoče več načinov, a najlažje je verjetno, da uporabite spletni PDB pretvornik, kot je Zamzar . Datoteko PDB lahko naložite na to spletno mesto in jo lahko pretvorite v tiste oblike, kot tudi na AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT in druge oblike zapisa datotek.
Če želite pretvoriti datoteko PDB v format FASTA, lahko s spletnim PDB-jem Meiler Lab pretvorite v pretvornik FASTA.
Prav tako je mogoče pretvoriti PDB v CIF (format kristalografskega podatka) na spletu z uporabo PDBx / mmCIF.
Napredno branje na PPP datotekah
Več o datotekah zbirke programa Microsoft, GitHub in Wintellect lahko preberete več.
Še več je, če želite izvedeti več o datotekah s podatki iz Protein Data Bank; glej Worldwide Protein Data Bank in RCSB PDB.
Ali se vaša datoteka še vedno ne odpre?
PDD datoteke, ki se ne odpirajo z nobenim od orodij od zgoraj, verjetno niso dejansko PDB datoteke. Kaj se lahko dogaja je, da napačno berete razširitev datoteke; nekateri datotečni formati uporabljajo pripono, ki je zelo podobna ".PDB", če sta res nepovezana in ne delata enako.
Datoteka PDF je na primer dokumentna datoteka, vendar večina programov od zgoraj ne bo pravilno prikazala besedila in / ali slik, če jo poskusite odpreti s temi programskimi programi. Enako velja za druge datoteke z razširitvami datotek, podobnih pismom, kot so datoteke PD, PDE, PDC in PDO.
PBD je še eden, ki spada v program EaseUS Todo Backup in je zato uporaben samo, ko je ta program odprt.
Če nimate PDB datoteke, potem raziskajte razširitev datoteke, ki jo ima vaša datoteka, da boste našli ustrezen program, ki ga odpre ali pretvori.